Sans grand bouleversement, par Philippe Brouard

Même si on observe une petite poussée du coronavirus en cette fin de mois de novembre, les indicateurs en cours ont tendance à montrer une situation qui n’est pas chamboulée. Pour commencer avec le simulateur CT, le réglage de R_effectif est évalué à 1,1 puis les deux hypothèses habituelles de montée ou descente sont activées.

En conséquence, à autres réglages constants, voici le calcul de prolongation des courbes pour la situation hospitalière.

On continue à observer une tendance à la baisse de la létalité hospitalière, bien que ça soit plutôt lent. Il y a aussi une tendance à l’augmentation de la durée moyenne de séjour. Ça a déjà été observé en fin de vague lors d’épisodes précédents, mais en ce moment la charge hospitalière n’est pas particulièrement faible. Donc c’est peut-être un point négatif à surveiller.

Pour se projeter vers des fêtes de fin d’année tranquilles, il faudra surveiller R_effectif afin qu’il reste en dessous du scénario médian ( < 1,1 ) avec l’objectif d’éviter d’avoir 25 000 patients hospitalisés à Noël. Restons vigilants, tous ensembles.

La nouvelle cuvée… par JCD

La dernière vague BA5 a été relativement modérée en ampleur avec un peu moins de 60 000 cas mi-octobre. Probablement un effet du beau temps, en ce début d’automne, puisqu’on a atterri sur le scénario bas évoqué la dernière fois plutôt qu’à 100 000 cas (scénario haut).

Sitôt la vague BA5 terminée, voici déjà la nouvelle cuvée qui pointe son spike à l’horizon : omicron BQ 1.1

BQ 1.1 arrive dans un contexte où :

• La vaccination ne protège plus en masse contre les infections (ancienneté des doses trop grande).
• Un peu plus de 2 Millions de personnes ont été infectées depuis le dernier article (donc sans doute le double en comptant les asymptomatiques/non détectés).
• Une grande majorité de la population a été contaminée (probablement autour de 90% à fin novembre. Cf le précédent article).
• Les pourvoyeurs de données (labos) sont plus ou moins en grève depuis le début du mois… Donc difficile de suivre l’épidémie.

Néanmoins, en regardant les chiffres sur octobre, avant que la remontée de données ne devienne trop chaotique, on voit que BQ 1.1 remplace BA5 (passage de 10% à 40% de prédominance en 1 mois) beaucoup plus lentement que BA5 n’avait remplacé BA2 (passage de 10% à 40% de prédominance en 2 semaines).

Ceci permet d’estimer l’avantage de BQ1.1 à x1,7 par semaine, soit R₀(BQ1.1) = 1,3 x R₀(BA5) car omicron se ‘reproduit’ 2 fois par semaine (1,3² = 1,7).

Ceci est de très bon augure car l’avantage d’un variant omicron par rapport à un autre omicron est la donnée principale qui sert à évaluer la ‘violence’ d’une nouvelle vague.

Quand on rentre tout ça dans la moulinette, on obtient un très léger sursaut sur les courbes à mi-décembre :

(A noter : la courbe en « hérisson » de BQ 1.1 est purement liée aux artefacts de remontée de la donnée).

Et pour les réanimations :

Cette nouvelle vague omicron semble donc être dans le droit prolongement des précédentes : toujours beaucoup de cas par rapport aux vagues 2020/2021, avec des pics de plus en plus bas (mais avec une cinquantaine de morts par jour tout de même, et autant de personnes qui rentrent en réanimation).

A noter : Pasteur est sur une tendance similaire sur les 15 jours qui viennent.

Même si il faut rester prudent à cause des problèmes de remontée des données, la vague BQ1.1 semble donc modérée, ce qui serait une bonne nouvelle pour l’hôpital qui doit aussi gérer en parallèle grippes et bronchiolites.

En attendant la grippe par Daniel Le Breton

Omicron est comme le sparadrap du Capitaine Haddock, il nous colle aux basques et repointe le nez à chaque période de congés. La lassitude qui accompagne l’épidémie se voit dans les chiffres de rappel de vaccination, dans les transports sans masque, etc. bref, on vit avec maintenant.

Voici une illustration de l’évolution des cas et des entrées à l’hôpital pour montrer les aléas de récupération des données :

Les dates de mise à jour diffèrent (retard pour ce qui concerne l’hôpital). Au vu des graphes on a le sentiment que ça se prépare à grimper fortement mais le suivi d’autres paramètres (dérivée, ratio hebdomadaire) indique qu’on devrait être près d’un point d’inflexion.

Vous noterez que je n’ai pas fait d’estimation de nouvelle gaussienne pour l’épisode en cours, l’intérêt en est faible pour l’instant (la paresse doit y contribuer également). Mais pas de chance, ça remonte avec les congés alors qu’on avait une bonne tendance. Il va falloir attendre que ça baisse à nouveau vers les valeurs minimales quelque part courant décembre avant que ça redémarre avec les congés de Noël. On peut parier sans trop de risque que BQ1.1 va finir par dominer dans les semaines à venir, alors sommes-nous déjà dans une nième vague, pas facile à confirmer pour l’instant. On n’en a pas fini et on peut se demander comment va se passer le choc avec la grippe qu’on nous promet sévère (ah le bon vieux trouillomètre !).

A noter une petite remontée des cas en Afrique du Sud après quatre mois de paix royale. On n’a pas eu cette chance.