Nous y voilà, un confinement n°2 pour contrer l’épidémie de covid-19 a démarré hier dans notre pays. Fallait-il s’attendre à des mesures plus contraignantes ? C’était une des questions posées dans l’article du 19 août où nous avons commencé à imaginer un scénario d’endiguement de la seconde vague. La montée en puissance des contraintes sanitaires a cependant donné l’impression d’avoir un train de retard. Il pourrait être de plus en plus dur de trouver la bonne riposte. Le couvre feu de 21h à 6h dans les grandes métropoles a été en vigueur pendant deux semaines. Son effet est-il perceptible, par exemple via un signe d’amélioration de la situation ? L’actualisation de la simulation peut-elle nous fournir un indice ?

Vers 9000 patients en réanimation à la mi-novembre

Dans son allocution le 28 octobre, le Président Emmanuel Macron a annoncé cette phrase choc :

Quoi que nous fassions, près de 9000 patients seront en réanimation à la mi-novembre.

Emmanuel Macron, 28 octobre 2020

Le maximum d’occupation en première vague était de 7000 lits. C’est en partie cette sombre perspective qui a motivé l’instauration du second confinement. Le lendemain en conférence de presse, le Ministre de la Santé Olivier Véran a dévoilé le graphique source de cette simulation. Il s’agit d’une projection effectuée par l’Institut Pasteur, comme lors de la conférence du 1^er octobre.

Une chose est frappante sur ce graphique : la projection en couleur verte ne montre pas de fléchissement y compris en fin de graphique vers la mi-novembre ! Faut-il en déduire que l’Institut Pasteur estimerait que ce pourrait être plus de 15000 lits de réanimation occupés en décembre par les patients covid-19 ?

Les indicateurs Santé publique France restent trop élevés

Les trois indicateurs de pilotage selon Santé publique France restent à un niveau d’alerte très élevé; relevés pour la semaine 43 (19 au 25 octobre) dans le bulletin hebdomadaire du 29 octobre :

• Taux d’incidence national = 392 (50% plus élevé que la semaine précédente)
• Taux de positivité des tests = 18,6%
• Nombre de reproduction R_effectif = 1,42

Par ailleurs, nous surveillons les proportions de personnes asymptomatiques / symptomatiques, pour ajuster les réglages du simulateur, ces proportions sont stables :

Actualisation de la simulation hospitalière

R_effectif n’a pas suffisamment baissé

Pour ajuster le simulateur sur la courbe du nombre de nouveaux cas positifs testés, le réglage s’effectue sur l’évolution de la valeur de R_effectif. C’est l’indicateur qui pilote la croissance ou le ralentissement du nombre de nouvelles contaminations. Près de 50000 nouveaux cas détectés ces dernières 24 heures ! Malheureusement la décélération ne se fait pas sentir.

On pourrait pourtant constater l’amorce d’une tendance à baisser. Prenant en compte le nouveau confinement en vigueur, nous espérons voir enfin une nette baisse de R_effectif. C’est ce qui c’était produit lors du premier confinement. À noter que le contexte est différent en ce moment. Comme il s’agit d’un confinement « moins strict », la baisse pourrait être moins rapide. La valeur de R reste considérablement au dessus du chemin critique imaginé en août, et toujours au dessus de 1 en ce moment.

Évolution du nombre de nouveaux cas positifs

Le contexte reste celui d’une épidémie de SARS-CoV-2 qui s’aggrave. La nouvelle projection pour l’évolution du nombre de nouveaux cas positifs s’accélère à nouveau :

C’est assez frappant de remarquer que même avec l’hypothèse de R_effectif à la baisse de façon nette (de 1,3 à 0,8), la dynamique des contaminations en cours a une telle vitesse que l’effet souhaité de cassure de la courbe n’est pas encore visible sur ce graphique. Il faudra alors l’espérer vers la fin novembre et en décembre.

En conséquence dans les hôpitaux

Ça prend vraiment une mauvaise tournure. La nouvelle simulation CovidTracker confirmerait la tendance annoncée par l’Institut Pasteur. Les calculs ont été actualisés à réglages constants sur la situation en cours pour prolonger les courbes, sauf pour R qui est réglé avec l’hypothèse à la baisse.

Le nombre de personnes hospitalisées s’envolerait de façon très prononcée, bien au dessus du maximum de la première vague. La prévision du nombre de décès passerait de 15000 à 20000 pour la première période de cette seconde vague. Voici un zoom sur les deux courbes hospitalisations et réanimations :

On remarque un palier vers 10000 patients en réanimation dans la deuxième moitié de novembre*. Une chose positive malgré tout, à la différence de la projection de l’Institut Pasteur, il s’agirait là d’un maximum pour la seconde vague, pourvu que R_effectif soit à la baisse comme imaginé.

L’hôpital va-t-il tenir ?

Actualisation de la simulation dans les EHPAD et EMS

Poursuite de notre hypothèse de lien entre la situation hospitalière et celle dans les EHPAD et EMS. Le graphique actualisé du simulateur donne cette tendance :

Nous constatons une situation qui continue à se dégrader légèrement. La projection du nombre de décès est un peu plus élevée que la semaine dernière, sans prendre une allure aussi inquiétante qu’à l’hôpital.

Respecter les consignes

Pour le couvre-feu, l’effet positif sur l’épidémie n’est pas perceptible, ou alors c’est un effet noyé dans la dégradation. Le deuxième confinement, c’est la mesure extrême que tout le monde voulait éviter. Arrive-t-il trop tard ? Son efficacité peine à se montrer totalement radicale sur les graphiques de la simulation CovidTracker. Comme le disait la fable de La Fontaine, le Lièvre et la Tortue :

Rien ne sert de courir, il faut partir à point.

Il nous reste à jouer le jeu au maximum sur le respect des gestes et postures barrières. Le personnel soignant va avoir besoin de beaucoup de courage et d’énergie. Il compte sur nous tous, sans aucun doute.

Philippe Brouard

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*PS, actualisé le 01/11/2020, lors de l’émission de RTL Le Grand Jury ce dimanche, le Professeur Arnaud Fontanet (Institut Pasteur) annonce une prévision où le maximum du nombre de patients en réanimation serait de 6000 vers la troisième semaine de novembre, peut-être un peu plus, et si le confinement fonctionne bien (à réécouter vers la quarantième minute). Les journalistes en présence n’ont pas réagi au fait que cette annonce est différente des indications la précédente simulation de l’Institut Pasteur déjà citée.

*PS 2, actualisé le 03/11/2020, lors de l’émission de LCI le 20H du lundi 2 novembre, un nouveau graphique source Institut Pasteur a été présenté par le Professeur Remi Salomon de l’AP-HP. Il montre trois simulations, celle qui correspond à l’annonce du Président Emmanuel Macron du 28 octobre, celle qui correspond à ce que disait le Professeur Arnaud Fontanet le 1er novembre, et une troisième simulation plus optimiste.